Der Botanische Garten der RUB bietet mit seinen Gewässern sowie den unverfugten Steinmauern, z.B. im Bereich des Alpinums, einigen Amphibien- und Reptilienarten ideale Lebensbedingungen. Natürlich vorkommende Reptilien sind die Ringelnatter (Natrix natrix) und die Blindschleiche (Anguis fragilis). Auch Mauereidechsen (Podarcis muralis) können auf dem Gelände beobachtet werden. Diese Tiere stammen sehr wahrscheinlich von ausgesetzten Individuen aus privater Haltung. Unter den Amphibien sind der Grasfrosch (Rana temporaria) und die Grünfrösche (Gattung Pelophylax) als Bewohner des Botanischen Gartens zu nennen.
